2017 江苏省科技进步二等奖（排名第二）
2015 中国科学院科技促进发展奖 （排名第九）
2012　江苏省科技进步二等奖（排名第六）
2008 江苏省科技进步二等奖（排名第七）

1. Min Zhang, Feizhou, Chen, Xiaoli Shi, Zhen Yang, Fanxiang Kong. Association between temporal and spatial beta diversity in phytoplankton. Ecography, 2017, DOI: 10.1111/ecog.03340.
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3. Min Zhang, Baoli Qin, Yang, Yu, Zhen Yang, Xiaoli Shi, Fanxiang Kong. Effects of temperature fluctuation on the development of cyanobacterial dominance in spring: implication of future climate change. Hydrobiologia, 2016, 763: 135-146.
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1. 国家自然科学基金项目面上项目“春季水华蓝藻物候特征对温度与光照"错配"的响应及机制”（31470520），主持，2015-2018年.
2. 国家水体污染控制与治理科技重大专项课题“重点流域分散型点源处理及小流域综合整治长效机制研究与产业化示范”(2015ZX07218)，副组长，2015-2017年.
3. 江苏省太湖蓝藻水华预测预警业务化运行项目，主持，逐年持续运行.
4. 国家自然科学基金项目青年基金项目“温度波动对春季微囊藻优势确立过程的影响及机制”（31200353），主持，2013-2015年.
5. 江苏省自然科学基金项目“太湖蓝藻水华扩张的的主要气候变化驱动因子及其贡献”（BK2011877），主持，2011-2014年.
6. 江苏省科技厅太湖治理专项“太湖蓝藻水华暴发环境条件特征阈值研究”（BK2007748），主持，2007-2009年.
7. 国家水体污染控制与治理科技重大专项课题“重点流域分散型点源处理及小流域综合整治长效机制研究与产业化示范”(2015ZX07218)，副组长，2015-2017年.
8. 国家水体污染控制与治理科技重大专项课题“湖泊水源保护区物理－生态净化与水质保障技术及工程示范”(2008ZX07103005)，课题骨干，2008-2010年.
9. 国家水体污染控制与治理科技重大专项课题“重污染河道旁路净化与河口湿地生态重建技术及工程示范”(2012ZX07103002)，课题骨干，2012-2015年.
10. 国家科技基础项目“中国湖泊水质、水量和生物资源调查”（2O06FYllO6OO），科研骨干，2006-2011年.
11. 国家科技支撑项目 “应对太湖蓝藻水华的饮用水质保障应急技术研究及示范”（2007BAC26B01），科研骨干，2007-2009年.